تقع حديقة بافيا النباتية في موقعها الحالي منذ العقود الأخيرة من القرن الثامن عشر الميلادي ، بعد سلسلة معقدة من المحاولات لإيجاد موقع مناسب لزراعة وتعليم البسطاء في الكلية الطبية. أسست فولجنزيو ويتمان (1763-1773) أول استاذة في علم النبات ، وهو راهب من فالمبروسان تلميذ لماراتا ، الذي درس في بافيا من 1763 إلى 1773: في هذه الفترة دُعي لإعطاء توجيهات لبناء حديقة من البسطاء في أماكن مختلفة. من المقر الحالي للحديقة النباتية.
كان على وجه الخصوص الكونت Firmian ، مفوض هابسبورج للومباردي ، الذي حدد ما سيصبح المقعد النهائي في منطقة كنيسة S. Epifanio ، الملحق بدير آباء لاتيران. من أجل تصميم Orto Pavese ، في وقت مبكر من عام 1772 ، اقترح الكونت فيرميان للسلطات أن يأخذوا كنموذج لحديقة بسيطة من Padua ويستخدمون بشكل خاص تجربة G. Marsili ، التي أخرجتها بعد ذلك. أرسل تقريرًا تم فيه توضيح خصائص الحديقة المخصصة للتدريس. كان لدى سلطات ميلانو ، مقر نائب الملك النمساوي ، خريطة لحديقة شونبرون ، ثم أخرجها Jaquin وواحدة من حديقة فيينا.
خلال الاتجاه اللاحق لـ Augusto Pirola (1982-1996) تم تقديم مجموعات جديدة (Hydrangea، Pelargonium، Hosta) وتم تعديل إعداد مجموعة الورد. منذ عام 1997 ، أصبحت الحديقة النباتية جزءًا من قسم البيئة في الإقليم والبيئات الأرضية ، حيث تم دمج معهد علم النبات. من نفس التاريخ يبدأ اتجاه ألبرتو بالدوزى (1997-2002) حيث تم وضع أسس مجموعة من النباتات الطبية. علاوة على ذلك ، تم إجراء تدخلات صيانة مهمة. المدير الحالي هو فرانشيسكو سارتوري.
